中国新军预见了世界的正确反应，却没有将之无限地宽容下去，毕竟，中国新军有自己的利益在，所以，在会见了天皇以后，又开始对日本政府进行指导。
栗云龙说：“指导日本政府的建树更生，是我们中国新军义不容辞，当仁不让的责任。”
日本政府没有异议，严格地说，是日本政府的前成员，因为，现在日本的政府还在战俘营里，刚刚得到释放，连办公室也没有，就连吃饭还得找中国新军施舍，不过是一群摇尾乞怜的叫化子。
在中国新军的要求和安排下，日本新一届政府迅速成立。
铃木清秀仍然为政府的内阁总理大臣，又称首相，然后，从现有的各界人等中抽取精英分子，山下贺国大将被中国新军指定为军事防卫长官。前原则为通产省和外务省的负责人。在政府要员以及相关的军事系统中，由中国新军军团部指定的人员，占了一半。
日本政府的构架，也按照中国新军的意见，做了相当大的调整。首先，它取得了全部的行政权利。换句话说，天皇被要求放弃对政府的指导和控制，独立开来，成为自由的人，尽享荣誉和尊严，这一点儿非常重大，事实上，将日本的政体由二元制君主立宪方式转变为真正的议会制度。议会开始成为日本政治的真正中心，而天皇则成为专职的精神领袖，道义之主。首相成为真正的权利者。考虑到现在特殊的形势，中国新军要求，这个政府为暂时的，过度性的政府，等待日本新宪法的起草颁布施行以后，再进行普遍的选举，然后，确定政府和首相，阁员的任期等事项。
第二，军事系统取消半独立的状态，完全纳入日本政府的体系。以前，日本的政治军事中枢，是以天皇为核心很奇怪地分裂的。军事系统以军部为核心，在战时则组建大本营，更进一步地贴近天皇，甚至凌驾于政府，政府首相的很多指令，它根本不听，在战前的大山岩政府的独断专行年代，军事人员出任了首相，居然将政府完全控制了。现在，出于降低日本军事人员的地位和权利的考虑，归化之于政府统一管辖。取消军部，大本营等设置，改以陆军省和海军省，空军省等名目。同时，将全部的日本军事力量，缩小为防御性的武装团体，连名称也修改为军事防卫部队。
山下贺国大将，作为亲善中国新军的代表，忠心耿耿的代理人，担任军事长官，但是，并不能够控制全军，在临时状态结束以后，将取消这一职务。由三省的长官向首相负责。目前，中国新军已经指定了所有的三军指挥官，他们分别是，陆军省，山下，海军省，金口，空军省，猪口，将九州的三大名，全部升级到中央政府中。
在政府机关巨大变化的时候，地方体制没有变化，中国新军表示尊重日本政府的地方行政管理，不加干涉，让他们大大地松了一口气。
中国新军派遣了多名官员，到日本政府主持工作，特别是日本新军的建设。
将之前所有的日本军队，尽皆解散，罢免一切军官的职务。而以忠诚于中国新军的部队，一路追随参战的日本新军为核心，整编部队。
九州部队，四国的投降军，本州等历次战场上的投降者，被打散编制。首先确定了人数，中国新军要求，日本的军队，最大数量，不得超过八万。其中，陆军不得超过六万五千人，海军不得超过一万人，空军不得超过五千人。
日本军队可以拥有三军的建制，机构，名称一律为日本防卫队。
山下贺国，金口，猪口三位，全部确定为大将军衔。
日本的将级军官，特别是技术型将领，总数不得超过二十人。
凡是一切具有扩张主义，军国主义倾向的军官。或者现在有对中国新军憎恶态度的军官，立刻解职。
关于陆军方面，在具体的问题上，中国新军也做出了严格地研制。
例如，武器装备。举凡日本防卫军的武器弹药，禁止自行生产，一律从中国新军的奉天兵工厂采购。以银本位制度现金结算。任何关于武器方面的研制和生产的活动，都被视为非法，将要遭到严厉的制裁，日本政府自己更是要警惕和采取措施，否则，将要负责连带的责任。
日本新编防卫军，全部使用中国新军制造的标准步枪，整个陆军，可以拥有三十挺机枪，骑兵作为快速反应部队，被限制在一千人。关于炮兵，中国军队严厉要求，其总数不得拥有一百以上的野战大炮，口径在二百八十毫米的以前日本特别制造的海岸防卫大炮一百余门，必须全部交给中国新军，熔化消灭。
在现有陆军最为`关键的坦克等重装武器方面，中国新军要求，日本不得拥有，除非在战争时代有中国新军的特批许可，日本既不能装备或者购买，也不得自行研制。
关于海军，中国新军充分考虑到日本作为海洋国家的特殊地位，给予了较大的自主权，允许日军保留或者建造大型军舰，但是，炮火口径在八英寸以上的禁止建造，排水量在八千吨是极限。日本能够拥有的海军舰队总吨位，不得超过十万吨。炮火总量不得超过五百门。
日本的海军军舰，必须为自主研发制造，可以参照国际的建造资料和技术，但是，不得以任何形式接受外国列强的参与。
日本可以拥有鱼雷舰艇等。驱逐舰艇，巡洋舰等，战列舰袖珍型号也得经过中国新军检验和决定方可实施