研究院暂时下设武器弹药研究所、医药研究所、电子研究所、化工研究所、物理研究所五个部门。
武器研究所设枪械研究室、火炮研究室、弹药研究室。在宋哲武的计划里还要有特种车辆研究室和飞机研究室，只是搞车辆研究的王动还在美国，王动答应等宋哲武建立汽车厂时再回国帮助宋哲武。
不过，在王动给宋哲武的信中，他告诉宋哲武，他听宋哲武的哥哥宋哲文说，宋哲武甚至要建飞机厂，王动知道以宋哲文的财力是完全可以做到的，所以他告诉了他的大哥王助。而且，他已经说服了王助，如果宋哲武哪一天开始建立飞机厂，王助就会来帮助他。
对于王助，宋哲武可是知道的很清楚。王助麻省理工学院毕业，十几年前就是美国波音公司的第一任总工程师，在美国时，他受到了严重的种族歧视。尽管b※―c水上飞机的设计、制造都出自王助之手，但在进行飞行测试时，美国方面却不允许王助进入测试场地，担心他会偷学“美国最高航空技术”。这种明显针对中国人的歧视，使王助极为愤怒，不愿在美国忍受屈辱的王助，毫不犹豫地选择回国。1917年王助回国后，强烈要求北洋政府筹款创办飞机制造厂。1918年2月，中国家正规的飞机制造厂――马尾船政局海军飞机工程处成立，王助被任命为副处长。现在在那里研制水上飞机，已经有了几个机型。
宋哲武的飞机研究室就等着王助来，他在得到柯蒂斯的飞机后，就已经迫不及待地给去年就取得联系的王助去电，要王助来涞源主持飞机厂的前期筹备工作。
医药研究所的所长当然是王连章，为了更合理的利用现有的有限的人才，宋哲武成立了第四路军总部医院，院长也是王连章。原十九路军中跟随陶蓉一同来到第四路军的两个军医，其中一个还是博士也都交给他，加上汉口招来的几名湖北省立医科大学的学生，由王连章组建了两个实验室。这两个实验室一个主攻西药研究，一个主攻中成药物研究。宋哲武日思夜想的青霉素还要kao这个西药实验室给搞出来呢！
他已经要宋哲文给他买来了英国科学家弗莱明的专利和菌株，只是现在还没有人意识到青霉素的巨大效用，而且现在也没有人知道如何提纯。这些宋哲武也只是前世在网上知道一些，具体如何做，那还得王连章这个双料博士和原十九军那个医学博士来做。
电子研究所就由李明华负责，由他自己招收助手和学生；化工研究所的所长是王名扬，由于这个王名扬跟随宋哲武最久，他现在已经带出了一批学生，甚至经宋哲武的指点还取得了令他振奋不已的好几项成果；物理研究所所长就由李明华招来的同学郑大章担任。由于郑大章现在还在巴黎大学镭学研究所跟随居里夫人搞研究，虽然回电答应李明华，可是一时还是回不来的。但是宋哲武还是坚持成立暂时还没有一个人的物理研究所，并告诉箫国栋通知后勤处，每月给郑大章汇去所长薪水。
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